刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学分析

马文宇, 陈晓晓, 易婷婷, 李宏伟, 杜孟泽, 李秋明, 尹德琦

畜牧与兽医 ›› 2025, Vol. 57 ›› Issue (03) : 79-86.

刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学分析

  • 马文宇, 陈晓晓, 易婷婷, 李宏伟, 杜孟泽, 李秋明, 尹德琦
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摘要

旨在探究刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的结构功能以及其作为抗弓形虫疫苗的候选分子的潜力。通过NCBI数据库下载表面抗原相关序列蛋白SRS40E的基因序列和氨基酸序列,通过ORFfinder网站联合GENSCAN网站对其基因序列进行ORF分析,氨基酸序列依次通过Prot Param、Expasy-ProtScale、TMHMM、SignalP-4.1、SOPMA、SWISS-MODEL、IEDB、SYFPEITHI、VaxiJen 2.0程序对SRS40E蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构、信号肽、空间结构、磷酸化位点、抗原表位进行分析预测。结果:表面抗原相关序列蛋白SRS40E的基因序列全长1 627 bp,由396个氨基酸组成,理论分子量是42 204.65,等电点为7.87,分子式为C1818H2951N513O600S19,不稳定指数为47.19,脂溶性指数为72.73,亲水性总平均值为-0.314,预测显示为亲水性蛋白;该蛋白没有信号肽,具有跨膜结构;在二级结构中,α-螺旋占比18.94%、β-转角占比2.53%、β-折叠占比20.71%、无规则卷曲占比为57.83%;有53个磷酸化位点,其中30个丝氨酸磷酸化位点,22个苏氨酸磷酸化位点,1个酪氨酸磷酸化位点;有18个抗原决定簇,8个优势B细胞表位,8个优势辅助性T细胞(Th)细胞表位和2个优势细胞毒性T淋巴细胞(CTL)细胞表位。综上,表面抗原相关序列蛋白SRS40E包含多个B、T细胞表位,可作为弓形虫疫苗的候选蛋白。

关键词

刚地弓形虫 / 表面抗原相关序列蛋白 / SRS40E / 生物信息学

中图分类号

S852.7

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马文宇, 陈晓晓, 易婷婷, 李宏伟, 杜孟泽, 李秋明, 尹德琦. 刚地弓形虫表面抗原相关序列蛋白SRS40E的生物信息学分析. 畜牧与兽医. 2025, 57(03): 79-86

基金

北京农学院科技创新能力提升计划项目(QJKC-2023003)

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