中国帕利亚姆血清群中山病毒的分离及全基因组序列分析

寇美玲, 孟锦昕, 苗海生, 李乐, 谢佳芮, 高林, 廖德芳, 李华春, 宋建领

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畜牧与兽医 ›› 2024, Vol. 56 ›› Issue (07) : 65-71.

中国帕利亚姆血清群中山病毒的分离及全基因组序列分析

  • 寇美玲, 孟锦昕, 苗海生, 李乐, 谢佳芮, 高林, 廖德芳, 李华春, 宋建领
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摘要

旨在获取中国帕利亚姆血清群中山病毒(Chuzan virus, CHUV)毒株的全基因组序列并分析其遗传特征。应用BHK-21、Vero、MDBK细胞对云南省江城县采集的152份健康黄牛血液样品盲传分离病毒,针对出现细胞病变样品,采用CHUV VP7蛋白基因片段进行RT-PCR扩增和测序,并对阳性样品进行全长扩增及高通量测序,获得的全基因组序列进行遗传进化分析。结果:1份血液样品可致BHK 21、Vero、MDBK细胞病变;病毒基因组为10节段的“3-3-3-1”带型;病毒基因全长18 914 bp,各基因节段长度在728 bp(Seg-10)~3 930 bp(Seg-1)之间,编码6 072个氨基酸残基,编码蛋白在211(NS3蛋白)~1 295(VP1蛋白)个氨基酸残基之间;通过对保守基因Seg-1,Seg-3、Seg-7的核苷酸系统发育分析,显示与中国本土CHUV亲缘关系最近,为98.17%~99.65%,形成一簇;变异基因Seg-2的核苷酸序列同样与中国本土CHUV毒株相似度最近,为98.76%~99.57%。本研究表明中国CHUV毒株的Seg-1、Seg-3和Seg-7形成了独特的地域型,为深入揭示我国CHUV的致病性和病原学特征提供了基础数据。

关键词

中山病毒 / 分离 / 全基因组测序 / 序列分析 / 帕利亚姆血清群病毒

中图分类号

S852.65

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寇美玲, 孟锦昕, 苗海生, 李乐, 谢佳芮, 高林, 廖德芳, 李华春, 宋建领. 中国帕利亚姆血清群中山病毒的分离及全基因组序列分析. 畜牧与兽医. 2024, 56(07): 65-71

基金

云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室自主研究课题(2022RW004); 公益性行业(农业)科研专项(201303035)

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