甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定

张晓婷, 郑一青, 曾亦然, 常丽凤, 陈纳, 卢渊录, 罗皓炜, 高紫荷, 平继辉

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畜牧与兽医 ›› 2024, Vol. 56 ›› Issue (07) : 102-111.

甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定

  • 张晓婷, 郑一青, 曾亦然, 常丽凤, 陈纳, 卢渊录, 罗皓炜, 高紫荷, 平继辉
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摘要

环状RNA(circRNA)已被证明在众多生物过程中起着重要的调控作用,而circRNA在甲型流感病毒(IAV)复制过程中的功能尚不清楚。本研究旨在利用高通量测序分析IAV感染A549细胞后的circRNA表达谱变化来挖掘能够影响病毒复制的circRNAs并对其进行初步功能鉴定。利用测序结果,对全部circRNAs进行特征分析、差异表达筛选;对差异circRNAs进行GO分析、KEGG分析;对候选circRNAs进行qPCR、RT-PCR验证及Sanger测序鉴定,并通过空斑试验确定影响病毒复制的circRNAs。结果:本试验共筛选到11 630条差异表达circRNAs,对其中6条circRNA进行了鉴定,最终确定novel_circ_007428具有抗病毒作用。本研究对甲型流感病毒感染A549细胞后的circRNA表达谱进行了分析与鉴定,为进一步研究circRNA在流感病毒感染中发挥的调控作用奠定了基础。

关键词

环状RNA / 甲型流感病毒 / 基因芯片测序 / A549 / 表达谱 / novel_circ_007428

中图分类号

S852.65

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张晓婷, 郑一青, 曾亦然, 常丽凤, 陈纳, 卢渊录, 罗皓炜, 高紫荷, 平继辉. 甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定. 畜牧与兽医. 2024, 56(07): 102-111

基金

“十四五”国家重点研发计划(2021YFD1800205)

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