为探究兰州市宠物猫隐孢子虫的感染情况，采集兰州市五大主城区宠物猫粪便样品共计655份，提取DNA,采用套式PCR扩增结合测序的方法进行基因分型并构建遗传关系树。兰州市宠物猫隐孢子虫的感染率为3.97%(26/655),测序鉴定发现均为猫隐孢子虫(Cryptosporidium felis)。统计学分析结果显示，兰州市宠物猫隐孢子虫的感染率与品种、季节及样品来源显著相关(P<0.05)。结果表明，兰州市宠物猫携带隐孢子虫且存在传播给人的风险，研究结果为预防兰州地区人、猫感染隐孢子虫提供一定的依据。