4种猪腹泻病毒恒温隔绝式荧光RT-PCR检测方法的建立及应用

侯闻闻, 余良政, 樊毛迪, 朱振邦, 林成贤, 陈昌海, 李向东

畜牧与兽医 ›› 2023, Vol. 55 ›› Issue (09) : 83-88.

4种猪腹泻病毒恒温隔绝式荧光RT-PCR检测方法的建立及应用

  • 侯闻闻, 余良政, 樊毛迪, 朱振邦, 林成贤, 陈昌海, 李向东
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摘要

为鉴别猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)和猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)这4种猪主要腹泻病毒,本研究分别针对PEDV M基因、TGEV M基因、PoRV NSP5基因、PDCoV M基因设计特异性引物和探针,经过方阵法优化恒温隔绝式荧光RT-PCR(iiRT-PCR)反应条件,建立了检测这4种猪腹泻病毒iiRT-PCR方法。用建立的iiRT-PCR方法分别检测PEDV、TGEV、PoRV、PDCoV、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、日本脑炎病毒(JEV),并对iiRT-PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,结果显示该方法特异性强,对PEDV、TGEV、PoRV、PDCoV的检测下限分别为10~2、10~2、10~3、10~3 TCID_(50)/mL,并具有良好的组内和组间重复性;而荧光定量PCR方法的检测下限分别为10~1、10~2、10~2、10~2 TCID_(50)/mL,敏感性略高于iiRT-PCR。2种方法对22份临床样品的检测结果符合率为100%,PEDV、TGEV、PoRV、PDCoV阳性率分别为40.91%、9.09%、45.45%、9.09%,其中PEDV与PoRV混合感染率为18.18%,PDCoV与PoRV混合感染率为4.55%。本研究建立的iiRT-PCR为临床现场检测4种猪腹泻病毒提供了一种简便快速的方法。

关键词

猪流行性腹泻病毒 / 猪传染性胃肠炎病毒 / 猪轮状病毒 / 猪德尔塔冠状病毒 / 恒温隔绝式荧光RT-PCR

中图分类号

S852.651

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侯闻闻, 余良政, 樊毛迪, 朱振邦, 林成贤, 陈昌海, 李向东. 4种猪腹泻病毒恒温隔绝式荧光RT-PCR检测方法的建立及应用. 畜牧与兽医. 2023, 55(09): 83-88

基金

江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(21)2014]; 江苏现代农业产业体系建设项目(JATS[2022]361)

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