随着中药的普遍使用，其潜在的毒性风险也逐渐被人们所重视。目前中药毒性检测及其分子机制研究仍缺乏安全、高效、灵敏的技术体系。转录组学作为一门研究细胞内基因转录及其调控的学科，蛋白质组学作为研究生物体内蛋白质组成、结构、功能和相互作用的学科，均可为深入研究中药毒性提供了新视角和新方法。二者的联合应用可弥补因转录后调控、翻译效率等因素造成的基因表达与蛋白质表达之间的差异，可更全面地了解生物体在毒性机理下的分子变化，从分子层面更精确地解释毒性机制。本文综述了近年来转录组学和蛋白组学在中药毒性研究中的应用进展，旨在为中药的安全使用提供科学依据。