旨在了解新疆阿克苏地区绵羊无形体(Anaplasma ovis)及嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum)感染情况及分子特征。分别从阿克苏地区下辖9个县市采集羊全血共计540份。分别以编码热休克蛋白60(HSP60)的groEL基因、16S rDNA基因的部分序列(SSAP2)为靶基因，运用PCR方法检测其携带绵羊无形体和嗜吞噬细胞无形体情况；选择强阳性样本测序，运用MegaAlign进行同源性比对，运用Mega 11.0构建系统发育树。结果：无形体的总体感染率为44.81%(242/540),其中绵羊无形体感染率为35.74%(193/540),嗜吞噬细胞无形体感染率为11.67%(63/540),混合感染率为2.60%(14/540)。不同县市无形体感染率存在显著性差异(P<0.001)。在不同饲养环境下，散养户的绵羊无形体感染率最高，为57.22%(103/180),不同饲养环境下绵羊无形体的总体感染率差异显著(P<0.001)。本调查结果表明，新疆阿克苏地区是绵羊无形体及嗜吞噬细胞无形体流行区，应该加强无形体的防控与检疫。