1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析

沈学怀, 赵瑞宏, 尹磊, 侯宏艳, 戴银, 胡晓苗, 殷冬冬, 王洁茹, 潘孝成, 周学利, 刘永杰

畜牧与兽医 ›› 2025, Vol. 57 ›› Issue (04) : 60-70.

1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析

  • 沈学怀, 赵瑞宏, 尹磊, 侯宏艳, 戴银, 胡晓苗, 殷冬冬, 王洁茹, 潘孝成, 周学利, 刘永杰
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摘要

鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病,还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌,命名为SM24,评价该菌株的生长曲线,测定菌株致病性和半数致死量(LD50),用Kirby-Bauer法对分离株进行耐药性测试;通过全基因组测序构建分离株基因图谱,分析其携带的毒力和耐药基因特征。结果:分离株在LB培养基中生长良好;对SPF雏鸡具有明显的致病性,LD50为8.50×10~5 CFU;SM24为多重耐药菌株,对青霉素类、头孢菌素类、喹诺酮类、四环素类、磺胺类以及新霉素、庆大霉素、阿奇霉素和氨曲南等16种抗生素表现耐药,对大观霉素、阿米卡星、氯霉素、氟苯尼考、亚胺培南和多黏菌素B敏感;全基因组测序分析表明,SM24为印第安纳血清型沙门菌(Salmonella Indiana),序列型为ST17,基因组大小为4 865 511 bp, GC含量为51.96%,携带一个IncHI2质粒,大小为165 044 bp; SM24菌株基因组中携带280个毒力相关基因和144个耐药基因,其中整合移动元件(IME)位点和质粒上存在12个耐药基因;SM24菌株与国内报道的鸡源印第安纳沙门菌的遗传距离较远。综上,本研究分离鉴定到1株鸡源印第安纳沙门菌株,具有较强的毒力和多重耐药性,同时解析了菌株的全基因组特征,为深入研究印第安纳沙门菌的致病和耐药机制提供参考。

关键词

鸡源印第安纳沙门菌 / 致病性 / 耐药性 / 毒力基因 / 耐药基因 / 全基因组测序

中图分类号

S852.61

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沈学怀, 赵瑞宏, 尹磊, 侯宏艳, 戴银, 胡晓苗, 殷冬冬, 王洁茹, 潘孝成, 周学利, 刘永杰. 1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析. 畜牧与兽医. 2025, 57(04): 60-70

基金

安徽省重点研究与开发计划项目(202204c06020039); 国家蛋鸡产业技术体系项目(CARS-40); 安徽省农业科学院平台项目(2024YL016); 安徽省家禽产业技术体系项目(AHCYJSTX-06)

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