自身免疫性疾病是机体免疫系统对自身成分发生免疫应答而引起器官功能紊乱的一类疾病，难以彻底治愈，给患者造成巨大痛苦。抗菌肽是先天免疫系统的重要效应分子，可以通过多种免疫调节作用刺激或增强机体免疫反应，因而在自身免疫性疾病的治疗研究中被广泛关注。在自身免疫性疾病中，抗菌肽不仅对Ⅰ型糖尿病、类风湿性关节炎具有很好的治疗作用，还用于系统性红斑狼疮、银屑病、干燥综合征、系统性硬化症的治疗，并表现出良好的应用前景。探讨抗菌肽的免疫调控活性及其在自身免疫性疾病治疗中的研究进展，可以为抗菌肽免疫调控作用机制的深入研究提供文献支持，为抗菌肽今后在自身免疫性疾病临床应用上提供理论参考。