目的 收集睡眠呼吸暂停综合征(OSAS)合并高血压和原发性高血压(EH)患者进行全基因组甲基化测序寻找差异甲基化位点。在高血压人群，进一步探讨OSAS合并糖尿病与葡萄糖转运蛋白4基因[溶质载体家族2A4(SLC2A4)基因]DNA甲基化的关系。方法 全基因组甲基化阶段：从2010年1月至3月，连续招募年龄30～60岁、肾功能和肝功能正常的高血压患者，完善多导睡眠监测，中重度OSAS合并高血压患者作为试验组(12例),年龄、体重指数匹配的非OSAS EH患者作为对照组(12例),通过Microarray高通量基因表达检测外周血甲基化情况。单基因验证阶段：全基因组甲基化检测和京都基因和基因组数据库(KEGG)富集通路发现2型糖尿病通路有四个差异基因，选取其中的SLC2A4基因，进一步扩大样本量在高血压人群收集OSAS合并糖尿病(40例)、OSAS非糖尿病(66例)、非OSAS非糖尿病(39例)三组患者，验证单基因甲基化差异位点。结果 全基因组研究中，OSAS合并高血压相比较EH共鉴定出516个差异甲基化位点(低甲基化361个，高甲基化155个),所有选择的差异甲基化位点均存在显著性差异(P<0.05和∣Beta值差异∣>0.14)。通过基因本体(GO)、KEGG富集进行功能学基因富集分析。与非OSAS非糖尿病组相比，OSAS非糖尿病组中SLC2A4基因存在高甲基化位点：CpG2-11、CpG2-13、CpG2＿15、CpG1＿18、CpG2＿21.22、CpG2＿23.24和CpG22＿27;OSAS合并糖尿病组高低甲基化位点并存，低甲基化位点为CpG1＿2、CpG1＿5、CpG2＿6、CPG17、CPG110.11、CPG117、CPG118.19、CPG214、CPG218、CPG225、CPG227,高甲基化位点为CpG2-13、CpG2＿15和CpG2＿20。结论 OSAS合并高血压较EH,存在差异甲基化位点，为后续甲基化研究提供差异甲基化基因数据库。选取2型糖尿病通路中的SLC2A4基因进行单基因验证，证实该基因甲基化差异参与OSAS糖尿病共病。