目的：分析肝细胞癌临床诊断中CT和MRI影像学检查的应用价值。方法：选取2021年12月—2023年12月新疆生产建设兵团第六师医院收治的200例疑似肝细胞癌患者，均实施CT、MRI检查，以病理检查结果为金标准，比较CT和MRI诊断肝细胞癌的效能。结果：200例疑似肝细胞癌患者经病理检查后确诊153例；CT检出恶性138例，误诊1例，漏诊16例；MRI检出恶性147例，无误诊，漏诊6例；MRI诊断肝细胞癌的灵敏度及准确率均高于CT检查，差异有统计学意义(P<0.05)；MRI检查直径<1 cm病灶的检出率高于CT检查(P<0.05)，两种方式对直径1～3 cm、<3 cm病灶的检出率比较，差异无统计学意义(P>0.05)。结论：临床诊断肝细胞癌患者时，与CT检查相比，MRI检查整体诊断价值更高，其可明确病灶供血动脉的实际情况，提高对微小病灶的检出准确率，为疾病诊断提供有效信息，促进疾病的早期诊断和治疗。