研究不同生活环境下棘胸蛙（Quasipaa spinosa）肠道微生物的差异，利用16S rRNA高通量测序技术，对中国东部（浙江）、中部（广东和江西）和西部（广西和贵州）3个地理种群的棘胸蛙进行肠道菌群的多样性和功能分析。测序结果显示：东部、中部和西部地区共有OTU 530个，各地区特有OTU分别为48、123、118个。西部地区棘胸蛙肠道菌群的物种丰富度和多样性最高，3个地理种群棘胸蛙的优势菌门均为拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）和厚壁菌门（Firmicutes）。在属水平上，西部地理种群的阿克曼菌属（Akkermansia）、沙雷氏菌属（Serratia）丰度显著高于其他2个地理种群，东部地理种群的小螺菌属（Mucispirillum）丰度较其他2个地理种群高。3个地理种群棘胸蛙肠道微生物功能也存在共性，主要集中于新陈代谢中的能量代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢等方面。本研究从肠道微生物角度探究棘胸蛙的环境适应性，为其生态保护和健康养殖提供新的理论依据。