肠道寄生虫病是人兽共患病，不仅危害自然状态下的野生动物健康，影响野生动物种群发展，还能通过多种途径向人类传播。为了解北京市野生有蹄类动物肠道寄生虫感染情况，采集北京市云蒙山和雾灵山自然保护区狍（Capreolus pygargus）粪便样品，采用饱和食盐水漂浮法和分子生物学鉴定方法进行肠道寄生虫检测。结果显示：饱和食盐水漂浮法检测到云蒙山和雾灵山自然保护区狍肠道寄生虫阳性感染率分别为61.29%和85.71%，共检测到球虫（Coccidia sp.）、吸虫（Trematoda sp.）、细颈线虫（Nematodirus sp.）和鞭虫（Trichuris sp.）4种肠道寄生虫虫卵、卵囊或包囊，云蒙山狍感染率分别为61.29%、22.58%、12.90%和0，雾灵山狍感染率分别为76.19%、9.52%、4.76%和4.76%。感染强度分析结果显示，雾灵山狍粪便样品中肠道寄生虫虫卵、卵囊或包囊的感染强度较高。对有蹄类动物4种常见肠道寄生虫的分子鉴定显示，云蒙山和雾灵山自然保护区狍肠道寄生虫阳性总感染率分别为22.58%和19.05%，云蒙山狍普通圆线虫（Strongylus vulgaris）、毛圆属线虫（Trichostrongylus sp.）、隐孢子虫（Cryptosporidium sp.）和十二指肠贾第虫（Giardia duodenalis）的感染率分别为3.23%、16.13%、3.23%和0，雾灵山狍感染率分别为9.52%、0、0和9.52%。调查显示，北京市云蒙山和雾灵山自然保护区狍肠道寄生虫感染率较高，应及时采取有效措施，加强对野生动物肠道寄生虫病的防控，研究结果为北京市自然保护区野生动物肠道寄生虫病的防治提供了参考。