麝鼠Bad基因生物信息学分析

崔元曦, 田宇, 佟晓凤, 苏醒, 华思锐, 白素英

野生动物学报 ›› 2025, Vol. 46 ›› Issue (01) : 81-89.

麝鼠Bad基因生物信息学分析

  • 崔元曦, 田宇, 佟晓凤, 苏醒, 华思锐, 白素英
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摘要

B淋巴细胞瘤-2基因相关启动子(Bcl-XL/Bcl-2 associated death promoter,Bad)是麝鼠(Ondatra zibethicus)香腺miRNA测序筛选出的显著差异miRNA靶基因之一。为了解麝鼠Bad基因的基因结构和生物学功能,探讨其在麝鼠香腺发育和泌香中的作用,通过比对麝鼠的全基因组获得麝鼠Bad基因的CDS区序列,并利用多种在线预测软件进行生物信息学分析。结果表明:麝鼠Bad基因的CDS区全长为615 bp,编码204个氨基酸;编码的蛋白相对分子质量为22 087.40,等电点为9.63,不稳定系数为72.03,平均亲水系数为-0.885,是不稳定的亲水蛋白;无跨膜结构,无信号肽,有26个潜在的磷酸化结合位点。亚细胞定位结果显示,该蛋白主要定位于线粒体。二级结构主要由α-螺旋(32.84%)、无规则卷曲(56.86%)、β-转角(4.90%)和延伸链(5.39%)构成。构建系统发育进化树结果显示,麝鼠与仓鼠科(Cricetidae)亲缘关系最近,说明Bad基因在进化过程中相对保守。蛋白质互作预测结果显示,Bad蛋白与Bcl-2、Akt、Ywhaq、Ywhaz和Ywhab等蛋白相互作用,提示Bad蛋白与这些蛋白间的相互作用可能促进麝鼠香腺萎缩;与Mapk8等互作提示在香腺发育时具有抑制凋亡的作用。研究结果为进一步探究麝鼠Bad基因在香腺周期性发育中的功能提供参考。

关键词

麝鼠 / Bad基因 / 生物信息学分析

中图分类号

Q953

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崔元曦, 田宇, 佟晓凤, 苏醒, 华思锐, 白素英. 麝鼠Bad基因生物信息学分析. 野生动物学报. 2025, 46(01): 81-89

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