梅花鹿DLX5基因克隆及表达分析

王鹏, 刘方政, 李萱博, 王春花, 于海浩, 夏彦玲

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野生动物学报 ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (01) : 50-57.

梅花鹿DLX5基因克隆及表达分析

  • 王鹏, 刘方政, 李萱博, 王春花, 于海浩, 夏彦玲
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摘要

为研究梅花鹿(Cervus nippon)DLX5基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿DLX5基因进行克隆,获得包含全部编码区的c DNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过KEGG富集分析其信号通路,运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况。结果表明:梅花鹿DLX5基因编码区长为870 bp,共编码289个氨基酸。DLX5蛋白为可溶性的不稳定蛋白,有2个保守结构域,主要定位于细胞核。梅花鹿DLX5蛋白与许多不同物种来源的DLX5蛋白氨基酸序列有较高相似度,比较保守。DLX5蛋白二级结构中无规则卷曲占比最大(78.89%),其后依次是α-螺旋、延伸链,占比分别为16.96%和4.15%。DLX5基因主要的作用通路为TGFβ信号通路、MAPK信号通路和Wnt信号通路等。实时荧光定量RT-PCR结果表明,DLX5基因在鹿茸生长后期(三杈茸)表达量显著增高,这种上调表达暗示了其在鹿茸骨化过程中发挥重要作用,说明其可能是鹿茸骨化相关候选基因。

关键词

梅花鹿 / DLX5基因 / 基因克隆 / 生物信息学分析 / 实时荧光定量RT-PCR

中图分类号

Q785

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王鹏, 刘方政, 李萱博, 王春花, 于海浩, 夏彦玲. 梅花鹿DLX5基因克隆及表达分析. 野生动物学报. 2024, 45(01): 50-57

基金

国家级大学生创新训练项目(202210225170); 黑龙江省哲学社会科学研究规划项目(21TQB117)

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