孤立性侧脑室扩张胎儿孕妇羊水外泌体miRNA差异表达谱

李粉霞, 林浩生, 黎一琳, 朱雯倩, 孙元洁, 黄源, 裘毓雯, 秦霞, 常清贤

南方医科大学学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (11) : 2256-2264.

孤立性侧脑室扩张胎儿孕妇羊水外泌体miRNA差异表达谱

  • 李粉霞, 林浩生, 黎一琳, 朱雯倩, 孙元洁, 黄源, 裘毓雯, 秦霞, 常清贤
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摘要

目的 探讨孤立性侧脑室扩张胎儿孕妇羊水外泌体中的微小RNA(miRNA)的差异表达,对其靶基因进行预测分析。方法收集2021年9月~2024年5月在南方医科大学南方医院产前超声诊断为胎儿中度孤立性侧脑室扩张的孕妇羊水样本9例,和由于高龄或唐筛高风险行羊水穿刺的正常胎儿对照组的孕妇羊水样本8例。分离羊水外泌体,运用miRNA测序技术筛选两组羊水外泌体中的差异表达miRNA,并从中挑选3个在对照和样本组中的表达差异显著,且文献报道参与的信号通路和侧脑室关联的miRNA进行qPCR验证测序结果。对显著差异表达的TOP 40个miRNA进行靶基因预测及功能分析(GO)和信号通路分析(KEGG)。通过双荧光素酶报告基因技术验证miR-122-5p对预测靶基因AKT3和CCDC88C的调控。结果 与对照组相比,侧脑室扩张组中存在272个显著差异表达miRNA,其中表达上调的有43个,表达下调的有229个。GO分析发现靶基因主要功能与转录因子结合、转运蛋白活性、神经系统过程、跨膜运输等有关。KEGG通路分析发现富集显著的功能通路包括有MAPK信号通路、Wnt信号通路、配体-受体神经活性互作和细胞因子-细胞因子受体互作等。qPCR验证结果发现,与对照组相比,miR-122-5p表达显著下降(P<0.05),与测序结果一致;而let-7b-5p的表达病例组较对照组下调,与测序结果相反。双荧光素酶报告基因检测结果显示miR-122-5p不调控AKT3和CCDC88C的表达。结论 羊水外泌体中高丰度差异表达的miRNAs可能通过参与MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路和cGMP-PKG通路在胎儿侧脑室扩张的发生发展中发挥作用。

关键词

孤立性侧脑室扩张 / 羊水 / 外泌体 / 微小RNA

中图分类号

R714.5

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李粉霞, 林浩生, 黎一琳, 朱雯倩, 孙元洁, 黄源, 裘毓雯, 秦霞, 常清贤. 孤立性侧脑室扩张胎儿孕妇羊水外泌体miRNA差异表达谱. 南方医科大学学报. 2024, 44(11): 2256-2264

基金

广州市科技计划(202002020010)

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