HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值

纪凯, 于冠宇, 周乐其, 张天帅, 凌潜龙, 满文江, 朱冰, 张卫

南方医科大学学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (09) : 1685-1695.

HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值

  • 纪凯, 于冠宇, 周乐其, 张天帅, 凌潜龙, 满文江, 朱冰, 张卫
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摘要

目的 通过生物信息学和细胞实验探究HNRNP A1在结直肠癌中的临床意义及其在肿瘤组织中的表达情况。方法 使用HPA、TIMER和GEPIA数据库,分析HNRNP A1在结直肠癌组织中的表达水平,并检验HNRNP A1与Ki-67/VEGFA在结直肠癌中表达的相关性。使用Kaplan-Meier Plotter数据库评估HNRNP A1 mRNA水平与结直肠癌患者生存率之间的联系。通过基因富集途径分析,预测HNRNP A1在结直肠癌中的潜在生物学作用。通过免疫组织化学(IHC)和Western blotting技术检测HNRNP A1在结直肠癌及其癌旁组织中的蛋白表达。利用TIMER数据库网站对HNRNP A1在免疫浸润细胞中的表达进行预测。使用慢病毒敲低RKO/Caco2细胞中HNRNP A1的表达;通过CCK-8实验检测细胞增殖,使用克隆形成实验检测HNRNP A1对细胞增殖能力的影响;利用细胞划痕实验和Transwell迁移实验评估两组细胞(RKO/Caco2-nc、RKO/Caco2-sh)的迁移能力。最后验证HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)对肿瘤细胞增殖的影响。结果 在结直肠癌(CRC)肿瘤组织中HNRNP A1的表达显著上调并与患者的不良预后显著相关(P<0.01)。TIMER数据库的分析结果指出,HNRNP A1与肿瘤微环境中的免疫细胞之间存在一定的相关性。根据GEPIA数据库的分析,CRC组织中HNRNP A1、MKI67和VEGFA的表达均较高(P<0.05),且HNRNP A1与这两者之间存在正相关关系。通过Kaplan-Meier Plotter进行的生存分析表明,在CRC中,HNRNP A1的高表达预示着较差的总生存期(P=0.0081)和无进展生存期(P=0.012)。基因富集通路分析的数据显示,HNRNP A1可能参与到多个与CRC进展相关的生物途径中。HNRNP A1影响RKO/Caco2细胞的增殖和迁移能力,对照组(RKO/Caco2-nc)的增殖能力、克隆形成能力和迁移能力均优于实验组(RKO/Caco2-sh),差异有统计学意义(P<0.05);HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)可以有效抑制结直肠癌增殖活性,并具有时间和浓度依赖性;IHC显示HNRNP A1在结直肠癌中高表达,且与肿瘤分期有密切关系(P<0.0001)。结论 HNRNP A1基因在CRC组织中表达较高,并可调节细胞的增殖和迁移能力,与不良预后密切相关,同时HNRNP A1小分子抑制剂(VPC-80051)也可以抑制结直肠癌细胞的增殖,因而可作为CRC治疗过程中新的潜在治疗靶点。

关键词

结直肠癌 / HNRNP A1 / 增殖与转移 / 预后 / 生物信息学

中图分类号

R735.34

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纪凯, 于冠宇, 周乐其, 张天帅, 凌潜龙, 满文江, 朱冰, 张卫. HNRNPA1基因在结直肠癌组织中高表达及其潜在的诊断和治疗价值. 南方医科大学学报. 2024, 44(09): 1685-1695

基金

国家自然科学基金(82072750); 安徽省高校科学研究重大项目(KJ2021ZD0090); 促进市级医院临床技能与临床创新三年行动计划-研究型医师创新转化能力培训项目(SHDC2022CRT007); 蚌埠医学院研究生科研创新项目(Byycx22090); 安徽省2023年度新时代育人省级质量工程项目(2023xscx125)

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