功能性消化不良（functional dyspepsia,FD）是一种常见的慢性消化系统疾病，具有反复发作的特点。针对其胃肠动力障碍机制，促进胃肠动力是临床上最主要的治疗方式，但西药临床疗效欠佳，导致患者反复就医，影响患者的日常生活质量。而诸多研究证实，中药在改善患者FD临床症状及提高日常生活质量方面具有一定的优势。线粒体自噬功能紊乱与胃肠动力障碍有密切关系，PINK1/Parkin信号通路是介导线粒体自噬最经典的通路。研究表明，中药通过调控PINK1/Parkin信号通路可提高线粒体的稳态及重建线粒体质量，促进FD胃肠动力，并控制FD复发。该文就中药复方、中成药、中药单体化合物、中药提取物调控PINK1/Parkin线粒体自噬信号通路治疗FD进行综述，为进一步对中药靶向治疗FD的研究提供新思路。