疫病学具有一套独特的理论体系，疫病是由杂气引起的一类急性外感病，杂气并非外感六淫，不具有寒、热、温、凉等属性，但又可兼夹风、寒、暑、湿、燥、火等六淫邪气。杂气由口鼻而入，伏于膜原或中焦，传变形式包括表里九传、三焦传变、十二经传变、六经传变等多种形式，其病机本质是郁热内发，治疗以清里热为主。明清时期的疫病学家以清里热为基本治则，发展了汗、下二法，将汗法扩展为求汗之法，通过各种治法达到气机通、汗自出、邪随汗并的目的。下法不拘结粪，提出“时疫下不厌早”“时疫在下其郁热”等说法，从理法方药等方面将疫病与伤寒、温病进行区分，提出疫病不是伤寒，也不属于温病范围。疫病学理论对当今的传染病治疗仍具指导意义，疫病治疗注重逐邪外出，将清热、攻下等多种治法结合，并依据兼夹邪气随证加减，后期治疗时以养阴清余热为主，并注意顾护脾胃。该文将疫病、伤寒、温病3种外感病进行区别的目的是使医务工作者治疗现代疫病时有证可依、有的放矢。