目的 总结探析仝小林院士应用穿山龙治疗甲状腺疾病的药物配伍规律，为穿山龙治疗甲状腺疾病提供参考。方法 收集2015年1月—2023年1月在仝小林院士门诊就诊的患有甲状腺疾病且处方内含有穿山龙患者的病历，采用SPSS Statistics 26软件进行频数统计，SPSS Modeler 18.0软件进行关联规则分析和SPSS Statistics26软件的系统聚类方法进行聚类分析及对患者应用穿山龙治疗前后的肝功能进行统计分析，分析仝小林院士应用穿山龙治疗甲状腺疾病的药物配伍规律及安全性分析。结果 对仝小林院士使用穿山龙治疗甲状腺疾病常用的药物配伍经验进行分析总结，频数统计显示仝小林院士在治疗甲状腺疾病时用药以温、寒、平之性为主；药味以甘、苦、辛为主；用药归经以肝经为主，其次为脾、肺、肾、胃等，关联规则分析显示在治疗甲状腺疾病时最常用的靶方为穿山龙-三七-莪术-浙贝母；在不同原因所导致的甲状腺功能减退中用穿山龙-黄芪-当归-淫羊藿治疗气血亏虚、阳气不足之虚态，态靶同调；以穿山龙-夏枯草-牡蛎-五味子为治疗甲状腺结节之靶方，聚类分析得出仝小林院士常用来与穿山龙相配伍治疗甲状腺疾病的常用药物配伍。结论 穿山龙药性平和，靶向明确，仝小林院士在治疗甲状腺疾病时擅长运用“态靶辨治”的思想，通过不同配伍将穿山龙用于甲状腺疾病的治疗，且对于肝功能没有不良影响，对临床应用穿山龙治疗甲状腺疾病具有一定的指导意义。