多囊卵巢综合征作为一种女性最常见的内分泌疾病，其伴有的胰岛素抵抗，高雄激素血症以及不孕等临床表现严重影响女性的心理及生活。但其病机尚不明确，近年来宏观基因组学等技术的发展，肠道菌群被发现通过改变肠道通透性、参与免疫炎症反应、代谢以及肠脑轴等多种途径参与多囊卵巢综合征的发生发展，因此可以通过调节肠道菌群来治疗多囊卵巢综合征。而中医药治疗多囊卵巢综合征有明显疗效，大量研究证实中医药可以通过调节肠道菌群结构，改善肠道屏障，降低炎症损伤，增强肠道黏膜免疫来治疗多囊卵巢综合征。本文总结了近年来研究发现的多囊卵巢综合征患者肠道菌群的改变，参与多囊卵巢综合征发病机制以及中药复方和中药单体通过调节肠道菌群治多囊卵巢综合征的研究，为防治多囊卵巢综合征以及中医药的使用提供参考。