目的 探究小鼠感染流感病毒肺炎前后肺部菌群的变化及经麻杏石甘汤干预后对小鼠肺部菌群的影响。方法 采取滴鼻造模的方法建立流感病毒肺炎小鼠模型，经麻杏石甘汤或生理盐水干预不同时间后，提取小鼠肺组织进行16S rDNA测序数据处理及个性分析，探究麻杏石甘汤对流感病毒肺炎小鼠肺部菌群的影响。结果 16S rDNA测序结果显示，模型组厚壁菌门、拟杆菌门相对丰度降低，变形菌门、泛菌属、志贺菌属相对丰度增加。麻杏石甘汤组和奥司他韦组能降低变形菌门、志贺菌属相对丰度，增加厚壁菌门相对丰度。Alpha多样性分析显示给药7 d后麻杏石甘汤组、奥司他韦组小鼠肺部菌群丰富度及多样性均较模型组增加（P<0.05）;Beta多样性分析结果显示，给药7 d后，除模型组外各组样品点之间的距离小于给药3 d后，组间肺菌群构成有差异。结论 麻杏石甘汤干预流感病毒肺炎小鼠后，抑制小鼠肺部菌群中的有害菌增长，减少肺组织损伤程度。