目的 利用显微鉴定和植物代谢技术，分析不同采收季节远志显微结构和代谢物之间的特征。方法 根据其采收时间将收集的12批远志药材分为春采和秋采两组，通过性状和横切面显微结构观察两组样本的直观区别。采用超高效液相色谱-质谱（UHPLC-MS）分析采收季节对远志代谢轮廓调节作用，基于主成分分析（PCA）、偏最小二乘法-判别分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘法-判别分析（OPLS-DA）寻找差异代谢物。结果 远志春采样本木栓形成层、草酸钙簇晶明显，韧皮部裂隙明显。多元统计分析得到差异代谢物共219个，经质荷比（m/z）结合数据库指认得到29个，其中dihydrojasmone、pseudoionone等22个代谢物在秋采远志中含量较高；lauroyldiethanolamide、N-nonanoylglycine等7个含量较低。上述代谢物富集得到鞘磷脂代谢、β-丙氨酸代谢、黄酮和黄酮醇生物合成、泛酸盐和辅酶A(CoA)生物合成、嘧啶代谢共5条代谢通路。结论 不同采收期远志的显微结构区别明显，差异代谢物种类丰富，显微鉴定和植物代谢技术可作为区分远志采收期的研究技术，应用于远志加工采收。