如何更有效地促进脑卒中患者上肢运动功能恢复一直是康复医学的研究热点。大量研究表明，重复经颅磁刺激(rTMS)可以通过调控大脑可塑性，恢复受损大脑半球间平衡，从而促进上肢运动功能恢复。然而，临床研究发现大脑受损程度不同，相同治疗方案往往达不到一致的效果。患者卒中位置、损伤程度以及治疗时的刺激部位、频率等因素都是影响治疗效果的相关因素。本文从rTMS治疗脑卒中后患者运动功能障碍的相关理论依据，包括两侧大脑半球交互抑制理论、代偿理论、双相平衡模型以及不同理论之间的区别进行综述，以期为临床精准治疗提供参考。