选用24只断奶仔猪随机分为空白组、模型组、自愈组、白头翁散(Pulsatilla powder, PP)组，以“外邪+内伤+疫毒”复合因素建立仔猪泄泻模型，并用PP治疗。造模期间，每日监测仔猪体质量、精神状态及粪便形态。试验结束后，采集结肠进行组织病理学观察及通过ELISA检测结肠组织炎症因子IL-1β、IL-6含量，16S rRNA分析结肠肠道菌群，RT-qPCR法测定结肠色氨酸代谢相关基因。结果显示，与模型组相比，PP能明显改善泄泻仔猪结肠病理状态，杯状细胞显著增多(P<0.05);显著降低泄泻仔猪结肠IL-1β、IL-6含量(P<0.05)。肠道菌群结果显示，PP升高了厚壁菌门(Firmicutes,P<0.01)、螺旋体门(Spirochaetota,P<0.01)和乳酸杆菌属(Lactobacillus,P<0.05)的丰度，降低了拟杆菌门(Bacteroidota,P<0.05)、普雷沃菌属(Prevotellaceae＿NK3B31＿group,P<0.05)和梭菌属(Clostridium＿sensu＿stricto＿1,P<0.01)的丰度。同时，PP显著降低了泄泻仔猪结肠TPH1 mRNA表达水平(P<0.05),升高了AhR(P<0.05)、IL-22 mRNA表达水平。结果表明，PP可能通过调节结肠肠道菌群及肠道色氨酸代谢相关基因缓解仔猪泄泻，为后续探究仔猪泄泻病证防治提供数据支持。