分别对国内4家BALB/c小鼠供应商提供的540只BALB/c小鼠进行肠道原虫检测。其中，供应商A 140只，供应商B 130只，供应商C 135只，供应商D 135只。分别采集每只小鼠的新鲜粪便样本以提取基因组，并根据人五毛滴虫(Pentatrichomonas hominis,P.hominis)、泰泽隐孢子虫18S rRNA基因序列引物进行巢氏PCR扩增，利用鼠三毛滴虫(Tritrichomonas muris,T.muris)16S-like rRNA基因序列引物进行PCR扩增并测序，以检测BALB/c小鼠肠道原虫的感染状况。结果显示，供应商A提供的140份小鼠粪便样本中，总肠道原虫感染率为7.1%(10/140),其中，T.muris虫阳性率为7.1%(10/140)、泰泽隐孢子虫(Cryptosporidium tyzzeri,C.tyzzeri)阳性率为2.1%(3/140)、P.hominis阳性率为7.1%(10/140),2种肠道原虫共感染率为7.1%(10只：T.muris+P.hominis)、3种肠道原虫共感染率为2.1%(3只：T.muris+P.hominis+C.tyzzeri)。供应商C提供的135份小鼠粪便样本中，总肠道原虫感染率为7.4%,其中，T.muris阳性率为7.4%(10/135),未检出C.tyzzeri和P.hominis感染。供应商B提供的130份小鼠粪便样本和供应商D提供的135份小鼠粪便样本中均未检出肠道原虫感染。遗传进化分析结果显示，本研究扩增的T.muris 16S-like rRNA基因序列与GenBank发表的T.muris的16S-like rRNA基因具有98.52%的同源性(GenBank No:AY886846.1),并且在遗传进化树中聚类为一独立分支；P.hominis 18S rRNA基因序列与GenBank发表的P.hominis 18S rRNA基因具有98.27%的同源性(GenBank No.AF156964.1),聚为一独立分支；C.tyzzeri 18S rRNA基因序列与GenBank发表的C.tyzzeri 18S rRNA基因同源性为99.87%(GenBank No.KJ000486.1)。综上，本研究对不同实验动物供应商提供的BALB/c小鼠进行肠道寄生虫检测，发现存在不同程度的肠道原虫感染情况，并发现有T.muris、P.hominis和C.tyzzeri等3种以上寄生虫共感染的现象，从而为今后预防和制定有效的防控策略提供科学依据。