牛源诺卡菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

赵岩, 任美奕, 仝静迪, 苏娅澜, 宋德源, 姜国均, 程佳, 高健, 刘明超

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中国兽医学报 ›› 2025, Vol. 45 ›› Issue (01) : 39-45. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2025.01.06

牛源诺卡菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

  • 赵岩, 任美奕, 仝静迪, 苏娅澜, 宋德源, 姜国均, 程佳, 高健, 刘明超
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摘要

诺卡菌(Nocardia)是一种革兰阳性菌,能感染奶牛乳腺引起乳房炎,导致奶牛乳腺组织出现化脓性肉芽肿病变等临床症状。为建立一种快速而准确的牛源诺卡菌检测方法,通过对NCBI上已登记的诺卡菌16S rRNA基因序列进行比对,筛选出一段保守序列,并针对该序列设计了1对引物及TaqMan荧光定量探针。经过验证,结果显示本研究建立的TanMan荧光定量PCR检测方法的Ct值与重组质粒在1×1010~1×10~2拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,其回归方程为y=-3.536x+43.78,相关系数R2=0.997 5,斜率为-3.536,扩增效率(E)=91%,且满足90%<110%的标准,特异性强,与其他病原之间无交叉反应。标准曲线的灵敏度较高,最低检测拷贝数为1×10~2拷贝/μL,灵敏度是普通PCR方法的100倍,且标准曲线具有良好的重复性,组内和组间的变异系数均小于2%。使用该方法检测了234份乳房炎奶样和80份牧场环境样本,阳性检出率为27.07%,而普通PCR方法的阳性检出率为19.43%,因此,该方法比普通PCR方法更灵敏。本试验建立的荧光定量PCR检测方法为牛源诺卡菌的临床检测提供了有效的工具。

关键词

诺卡菌 / 乳房炎 / TaqMan荧光定量PCR / 奶牛

中图分类号

S852.61

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赵岩, 任美奕, 仝静迪, 苏娅澜, 宋德源, 姜国均, 程佳, 高健, 刘明超. 牛源诺卡菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 中国兽医学报. 2025, 45(01): 39-45 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2025.01.06

基金

河北省自然科学基金资助项目(C202304074); 河北农业大学引进人才科研专项基金资助项目(3118133); 河北省现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(HBCT2024230201); 河北省奶/肉牛创新团队定州综合试验推广站资助项目(HBCT202318406)

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