鸭腺病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

赵自亮, 庄鸿琨, 黄忍, 朱桓奕, 程钟坤, 冯旭东, 王迎平, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 杨晓伟, 赵光伟

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (03) : 472-476+498. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.03.06

鸭腺病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

  • 赵自亮, 庄鸿琨, 黄忍, 朱桓奕, 程钟坤, 冯旭东, 王迎平, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 杨晓伟, 赵光伟
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摘要

为建立鸭腺病毒3型(duck adenovirus 3,DAdV-3)一种基于SYBR Green I染料的荧光定量PCR诊断方法,本试验根据DAdV-3基因组序列中相对保守的Fiber-2基因,通过普通PCR扩增,构建pMD19-Fiber2重组质粒为阳性标准品,在此基础上设计合成特异性引物进行实时荧光定量PCR方法的建立,对其灵敏性、特异性和重复性进行评价,并初步应用于临床样本检测。结果显示,针对DAdV-3的Fiber-2基因建立的SYBR Green I荧光定量PCR检测方法线性关系良好,相关系数0.998 9;检测DAdV-3的灵敏度为3.6×10~(2 )copies/μL,敏感性比普通PCR检测方法高100倍;该方法对鸭腺病毒1型、鸭疫里默杆菌等其他常见病原均无交叉扩增反应,批内、批间变异系数均小于5%;临床样本检测与普通PCR符合率100%。以上结果表明,所建方法特异性强、敏感性高且重复性好,适用于临床检测,该方法可为DAdV-3的临床诊断、流行病学调查以及防控提供技术支持。

关键词

鸭腺病毒病毒3型 / Fiber-2基因 / 实时荧光定量PCR

中图分类号

S852.65

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赵自亮, 庄鸿琨, 黄忍, 朱桓奕, 程钟坤, 冯旭东, 王迎平, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 杨晓伟, 赵光伟. 鸭腺病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用. 中国兽医学报. 2024, 44(03): 472-476+498 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.03.06

基金

贵州省科技支撑资助项目(黔科合支撑2023一般022); 鲁渝科技协作资助项目

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