2021―2022年川渝部分地区PRRSV分子流行病学及ORF5遗传特征分析

赵自亮, 左妤祺, 赵康燕, 方思颖, 程钟坤, 崔羽丹, 朱桓奕, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 赵光伟

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (03) : 437-444. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.03.01

2021―2022年川渝部分地区PRRSV分子流行病学及ORF5遗传特征分析

  • 赵自亮, 左妤祺, 赵康燕, 方思颖, 程钟坤, 崔羽丹, 朱桓奕, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 赵光伟
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摘要

为了解我国川渝地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)的流行情况及分子特征,本试验以RT-PCR方法对2021―2022年间收集的来自川渝地区的临床样本进行PRRSV检测,并进一步对阳性样本的ORF5基因进行测序分析,探究其流行现状以及遗传变异情况。结果显示,川渝两地PRRSV阳性率为20.5%(40/195),其中四川PRRSV阳性率为18.1%(15/83),重庆为22.3%(25/112)。对其中23份阳性样本的ORF5基因分析显示,所获PRRSV均为基因Ⅱ型,包含谱系1、3、5和8,以NADC30类毒株为主;其中四川地区毒株与上海、辽宁、湖南等地区毒株存在较近的亲缘关系,重庆地区与当地毒株的同源性较高;与目前临床中使用的疫苗毒株比较,发现23株临床样本ORF5序列中有3个B细胞表位和1个T细胞表位与疫苗株存在较大差异。本试验结果表明PRRSV感染在川渝部分地区仍较为严重,美洲型NADC30类毒株是当前流行的优势毒株,且与疫苗株存在一定的变异,该结果对川渝地区PRRSV的防控具有借鉴意义。

关键词

猪繁殖与呼吸综合征病毒 / 分子流行病学 / ORF5基因 / 遗传变异分析

中图分类号

S852.651

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赵自亮, 左妤祺, 赵康燕, 方思颖, 程钟坤, 崔羽丹, 朱桓奕, 倪兴维, 徐婷婷, 刘霞, 赵光伟. 2021―2022年川渝部分地区PRRSV分子流行病学及ORF5遗传特征分析. 中国兽医学报. 2024, 44(03): 437-444 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.03.01

基金

贵州省科技支撑资助项目(黔科合支撑2023一般022); 鲁渝科技协作资助项目

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