单细胞蛋白质组学分析能揭示细胞个体之间蛋白质的精细差异，在诸多重要领域具有重要的应用价值，已成为目前的研究热点；其难点在于单细胞内的蛋白质极其微量，需要解决样品处理过程中的损失问题、色谱质谱检测的灵敏度问题和低信号强度质谱数据的解析利用问题.本文从单细胞分选、样品处理、色谱质谱采集和数据分析等方面，综合评述了目前基于质谱的单细胞蛋白质组学分析方法的研究进展及其在生物医学领域的应用，并展望了其未来的发展前景.