目的 本文通过应用结构方程模型探讨体育理科生和普通理科生两类不同生源的运动康复专业胜任力差异，为高校运动康复专业人才培养提供参考。方法 对比某医科院校2015—2018级与2019—2023级两类不同生源的运动康复专业本科生胜任力。采用《运动康复本科生胜任能力调查问卷》收集胜任力数据。通过SPSS软件进行统计描述与探索性因子分析，使用AMOS软件进行验证性因子分析与结构方程模型分析。结果 体育理科生和普通理科生两类人群的模型拟合度均符合要求。专业知识与技能维度中体育学基础知识因素负荷值体育理科生高于普通理科生；医学基础知识则相反。综合素质与发展能力维度中基本的运动技能及身体素质两个因素负荷值体育理科生大于普通理科生；科研能力及临床合作能力两个因素则相反。结论 各院校应根据不同生源适当调整培养方案。