目的 分析三级公立医院绩效考核实行以来外科科室运行效率变化趋势，为医院优化资源配置、提高资源效率提供依据。方法 收集某综合性三甲医院2018—2022年外科科室投入产出指标面板数据，分别应用DEA-BCC和Malmquist指数模型进行静态效率和动态效率分析。结果 观测期间外科科室技术效率从0.756提升至0.822,其中纯技术效率提升0.029,规模效率提升0.041。全要素生产率总体向好，均值为1.024,其中76.92%(10/13)外科科室有提升。结论 医院在经受新型冠状病毒感染肺炎疫情严峻考验的同时，实现了外科科室运行效率的提升，但科室间发展资源冗余和不足共存、技术进步与倒退兼有，需进一步优化资源配置，实现规模效率促进、技术效率提升；同时，医院需建议卫生行政部门加大政策支持，推动以临床需求为导向的科技创新，促进关键技术的突破，以技术进度促进全要素生产率提升。