为有效防止采后樱桃腐烂，减少果品损失，先后对4批次室温贮藏的我国山东和美国产地新鲜健康甜樱桃进行观察，对初现病斑和腐烂樱桃果进行病原菌分离，采用分子生物学方法对其菌株进行鉴定，并接种健康樱桃果实进行致病性测定。结果表明：4批次从贮藏期开始腐烂的樱桃果实中共分离出12株真菌和16株细菌代表菌株，其中10株真菌具致病性，涉及6个种，分别鉴定为Alternaria sp.、Fusarium sp.、Epicoccum sorghinum、Dothiorella viticola、Nothophoma quercina和Paraconiothyrium brasiliense; 8株细菌具一定的致病性但致病力较弱，涉及6个种，分别鉴定为Pantoea sp.、Bacillus sp.、Tatumella sp.、Gluconobacter sp.、Phaseolibacter sp.和Sphingomonas sp.。不同产地采后腐烂樱桃分离的真菌和细菌种类不同，其致病力也存在差异。这一研究可为樱桃采后致腐病原的进一步防治以及采后防腐保鲜技术研发提供参考。