目的 探索肠道菌群组成变化及其相关代谢产物与心房颤动（atrial fibrillation, AF）进展的关系。方法 连续入选48例AF患者，分为PaAF组（paroxysmal AF，阵发性房颤，n=23）和PeAF组（persistent AF，包括持续性房颤和长期持续性房颤，n=25），并入选11例窦性心律（SR）患者作为对照，采用16S rRNA测序和液相色谱法检测其肠道菌群和血清氧化三甲胺（TMAO）、肉碱（carnitine）和胆碱（choline）的水平。结果 在门水平的菌种中，拟杆菌门在SR组患者肠道菌群中占比76.6%、在PaAF组占比69.1%，两组比例显著高于在PeAF组的45.0%（均P<0.01）；两组之间无统计学差异；厚壁菌门（Firmicutes）在SR组患者肠道菌群中占比18.7%、在PaAF组占比29.7%，两组比例显著低于在PeAF组的52.0%（均P<0.01），两组间无统计学差异。其他菌种类型如放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）和疣微菌门（Verrucomicrobia）等占比较低，且三组间差异无统计学意义。在科水平的菌种组成SR组、PaAF组和PeAF三组间多数菌种的组成无统计学差异。PCA分析提示SR组和PaAF组肠道菌群组成相似，但PeAF组与之显著不同。血清TMAO、肉碱和胆碱水平在三组间表达水平呈递增趋势，血清TMAO水平在SR组、PaAF组和PeAF组患者中的表达水平分别为1.21μmol/L、2.49μmol/L和3.28μmol/L，血清肉碱水平分别为34.85μmol/L、38.20μmol/L和46.47μmol/L，血清胆碱水平分别为10.41μmol/L、15.18μmol/L和18.49μmol/L，差异有统计学意义（趋势检验均P<0.01）。结论 肠道菌群组成变化及其相关代谢产物，TMAO、肉碱和胆碱水平与AF的进展相关，提示它们可能是促进AF发生发展的危险因素。