目的 探究经宏基因组二代测序（mNGS）技术诊断的非HIV耶氏肺孢子菌肺炎（PJP）患者的临床特征。方法 回顾性分析2021年1月1日—9月30日在徐州医科大学附属医院呼吸与危重症医学科住院的，经支气管肺泡灌洗液（BALF）二代测序确诊的9例PJP患者的临床资料，观察其临床表现、实验室检查指标、影像学表现、合并其他基础疾病、治疗及转归、mNGS检出病原学情况等。结果 9例PJP患者中，男性7例，女性2例，年龄17～70岁，平均年龄（54±15）岁。其中8例合并基础疾病，1例无基础疾病。4例患者长期口服激素及免疫抑制剂，2例仅长期口服激素。临床表现为发热、咳嗽、呼吸困难，胸部CT表现为斑片影，大部分伴磨玻璃密度影，同时伴有多发结节影、蜂窝影等。9例PJP患者均存在低氧血症，氧合指数平均值为（185±82）mmHg,外周血淋巴细胞计数均下降，平均值为（0.88±0.39）×10～9/L,其中8例CD4⁺T淋巴细胞计数明显下降，平均值为（250±187）个/μl,（1,3）-β-D-葡聚糖水平、乳酸脱氢酶（LDH）水平均显著升高，平均值分别为（347±193）ng/L、（819±420）U/L。9例患者中5例（55.6%）ΒALF标本mNGS检出耶氏肺孢子菌，2例痰和血标本（44.4%）mNGS同时检出耶氏肺孢子菌，2例患者仅痰标本mNGS检出耶氏肺孢子菌，但结合典型临床和影像学表现诊断为PJP,mNGS还检出其余多种病毒、多重耐药菌以及其他真菌等。经复方磺胺甲噁唑和卡泊芬净治疗后，好转4例，死亡5例。结论 非HIV感染免疫抑制患者罹患PJP的基础疾病多样，其发生与接受糖皮质激素及免疫抑制剂有关，疾病严重程度较重，混合机会性感染常见，病死率较高，mNGS诊断相较于常规实验室检查方法，有更高的敏感性与特异性，可作为PJP的有效诊断手段。