目的 探索和肝汤对功能性消化不良（functional dyspepsia,FD）的作用机制是否与肠道菌群以及Toll样受体4(Tolllike receptor 4,TLR4)信号通路有关。方法 18只6周龄SD大鼠随机分为正常组、模型组以及和肝汤组，每组6只。模型组与和肝汤组大鼠以夹尾应激法建立FD模型，造模后和肝汤组予0.918 g生药/100 g体质量的和肝汤灌胃7 d，干预结束后取十二指肠组织和盲肠内容物，荧光定量PCR检测TLR4基因转录水平，蛋白印迹法检测TLR4蛋白表达水平，免疫荧光和免疫组化法观察TLR4的表达位置，16S rRNA和液相色谱-质谱联用分析盲肠内容物中菌群和代谢物情况。结果 与正常组比较，模型组TLR4蛋白表达水平显著增加（P<0.01）；与模型组比较，和肝汤组TLR4表达下调（P<0.05）。免疫荧光和免疫组化显示，TLR4在各组十二指肠固有层和上皮层均存在表达。模型组相比正常组阳性着色增强（P<0.01），和肝汤组相比模型组阳性着色减弱（P<0.01）；但各组TLR4基因转录水平无显著差异（P>0.05）。与正常组比较，模型组盲肠内容物中疣微菌门丰度增加（P<0.05），而厚壁菌门丰度减低（P<0.05）；与模型组比较，和肝汤组拟杆菌门丰度提升（P<0.05），疣微菌门丰富下调（P<0.05）；各组间n-γ-谷氨酰谷氨酰胺等代谢物含量存在一定差异（P<0.05）。结论 FD大鼠十二指肠TLR4表达上调，同时肠道菌群和代谢产物的结构存在异常改变。和肝汤可通过调节肠道菌群和代谢产物的结构，下调TLR4在十二指肠的表达改善FD。