长链非编码RNA LOC102639982和LOC102636309与自身免疫性肝炎肝损伤的关联

吕思学, 刘莹, 李鑫, 魏诗雅, 蔡粉情, 刘杨

山西医科大学学报 ›› 2024, Vol. 55 ›› Issue (09) : 1154-1162. DOI: 10.13753/j.issn.1007-6611.2024.09.008

长链非编码RNA LOC102639982和LOC102636309与自身免疫性肝炎肝损伤的关联

  • 吕思学, 刘莹, 李鑫, 魏诗雅, 蔡粉情, 刘杨
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摘要

目的 探讨差异表达长链非编码RNA(lncRNA)LOC102639982和lncRNA LOC102636309参与自身免疫性肝炎肝损伤的生物学机制。方法 选取SPF级雌性C57BL/6小鼠12只,随机分为正常组和模型组。模型组采用尾静脉注射刀豆蛋白A(concanavalin A,ConA)制备自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis,AIH)小鼠模型,正常组注射生理盐水。收集各组小鼠的肝脏和血清,采用HE染色观察肝细胞坏死程度和肝脏炎症细胞浸润程度,ELISA法检测血清谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、一氧化氮(NO)和丙二醛(MDA)含量的变化。qRT-PCR检测lncRNA LOC102639982和lncRNA LOC102636309在肝脏中的表达水平,并对两种lncRNA共表达的mRNA进行GO和KEGG富集分析以及lncRNA-转录因子关联分析。结果 HE染色结果显示,模型组小鼠肝细胞变性坏死,出现大量炎性细胞浸润。与正常组比较,模型组小鼠肝组织NO、MDA水平及血清ALT、AST水平均显著升高(P<0.01)。qRT-PCR结果显示,lncRNA LOC102639982和lncRNA LOC102636309表达变化的结果与微阵列芯片的表达趋势一致。qRT-PCR结果结合肝损伤结果表明,微阵列芯片的结果变化趋势与肝损伤指标变化趋势一致。生物信息学研究结果表明,lncRNA LOC102639982和lncRNA LOC102636309共表达的mRNA的主要分子功能是蛋白结合,主要富集在生物过程中的转录调控、DNA模板化。与lncRNA LOC102639982共表达的mRNA主要富集于细胞因子与细胞因子受体相互作用和TNF信号通路,而与lncRNA LOC102636309共表达的mRNA主要富集于MAPK和NF-kappa B信号通路。lncRNA LOC102639982与转录因子NR4A1和ATF3的相关性最强,而lncRNA LOC102636309与转录因子Fosl2的相关性最强。结论 lncRNA LOC102639982和lncRNA LOC102636309的差异表达与自身免疫性肝炎肝损伤密切相关,两者均可能是预防和治疗自身免疫性肝炎的潜在靶点。

关键词

自身免疫性肝炎 / 长链非编码RNA / GO分析 / KEGG富集分析 / lncRNA / 转录因子关联分析

中图分类号

R575.1

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吕思学, 刘莹, 李鑫, 魏诗雅, 蔡粉情, 刘杨. 长链非编码RNA LOC102639982和LOC102636309与自身免疫性肝炎肝损伤的关联. 山西医科大学学报. 2024, 55(09): 1154-1162 https://doi.org/10.13753/j.issn.1007-6611.2024.09.008

基金

国家中医药管理局高水平中医药重点学科建设项目(zyyzdxk-2023022); 中西医结合防治风湿免疫病山西省科技创新人才重点团队项目(202204051002033); 山西省科技合作交流专项重点国别科技合作项目(202104041101013); 山西省应用基础研究计划青年科学基金项目(202203021222272); 山西省中医药管理局科研课题计划项目(2024ZYYAD008); 山西中医药大学科技创新团队项目(2022TD2003)

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