葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选

陈雪琴, 庞倩倩, 裴丹, 任艳华, 房经贵

南京农业大学学报 ›› 2023, Vol. 46 ›› Issue (05) : 852-861.

葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选

  • 陈雪琴, 庞倩倩, 裴丹, 任艳华, 房经贵
作者信息 +
History +

摘要

[目的]本文旨在揭示组蛋白乙酰转移酶GCN5(general control non-repressible 5)在葡萄生长发育过程中的调控机制,并筛选出与VvGCN5互作的蛋白,以期为进一步构建VvGCN5在葡萄生长发育中的调控网络提供理论基础。[方法]利用生物信息学技术对VvGCN5的蛋白二级结构、基因结构、功能域、启动子的顺式作用元件以及抗逆的表达量和时空表达进行分析,并在烟草中进行亚细胞定位,研究VvGCN5表达位置。通过酵母双杂交技术筛选与VvGCN5互作的蛋白,并通过双分子荧光互补(BIFC)技术进行验证。[结果]VvGCN5的二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠以及无规则卷曲构成,含有10段内含子序列和11段CDS序列,具有Acetyltransf_1和Bromodomain结构域,以及ARE、GT1-motif、TGACG-motif、CAT-box、CGTCA-motif等顺式作用元件。通过查询GEO数据库发现VvGCN5可能受到光照和灰霉病的影响。VvGCN5主要表达于葡萄的成熟茎、萌芽初期、心皮、种子中。亚细胞定位发现VvGCN5位于细胞核和细胞膜上。此外,以pGBKT7-VvGCN5作为诱饵蛋白,通过酵母双杂交技术和双分子荧光互补技术发现8个阳性蛋白与VvGCN5互作。[结论]本研究鉴定并分析了VvGCN5的基本信息,并得到了8个与VvGCN5互作的蛋白。

关键词

葡萄 / VvGCN5 / 酵母双杂交技术 / 双分子荧光互补 / 生物信息学分析

中图分类号

S663.1

引用本文

导出引用
陈雪琴, 庞倩倩, 裴丹, 任艳华, 房经贵. 葡萄VvGCN5基因的鉴定及互作蛋白筛选. 南京农业大学学报. 2023, 46(05): 852-861

基金

国家重点研发计划项目(2019YFD1001904); 国家自然科学基金项目(31901991); 江苏省自然科学基金项目(BK20190529); 江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(21)3023]

评论

Accesses

Citation

Detail

段落导航
相关文章

/