目的 采用多维指纹图谱结合化学计量学方法，比较枸杞果实和根皮中黄酮、香豆素类和苯丙酸类等成分的整体差异，并综合多糖和总黄酮的含量比较，为枸杞不同药用部位的价值评估和质量标准的建立提供理论依据。方法 建立HPLC指纹图谱进行相似度评价和共有峰确定。化学计量学方法对药材不同部位进行分类研究，建立分类模型，筛选出重要差异性标志物并进行定量分析；紫外-可见光谱（UV-Vis），反映药材化学组成的整体特征；采用2020年版《中华人民共和国药典》苯酚-硫酸法测定枸杞多糖的含量，亚硝酸钠-硝酸铝比色法测定总黄酮含量。结果 HPLC指纹图谱共标定9个共有峰，指认了绿原酸、东莨菪内酯、槲皮素、芦丁4个色谱峰。相似度评价表明果实和根皮整体组成差异较大，地骨皮不同产地之间质量缺乏一致性；正交偏最小二乘法-判别分析找出芦丁是对整体差异性贡献比较大的化学成分；UV-Vis呈现明显的指纹特性；枸杞子中枸杞多糖和总黄酮的含量分别为2.74%～3.79%和1.52%～2.24%，均高于地骨皮中1.92%～2.67%和0.46%～0.58%，且含量分布具有产地差异性。结论综合多指标揭示枸杞果实和根皮中化学成分差异，为枸杞药材的质量评价和资源价值的充分利用提供重要的数据参考。