“脏腑别通”理论中提出少阴肾与少阳三焦气化相通、共主枢机，具有通行元气、司水液代谢的作用；“阴升阳降”理论中提出少阴肾与少阳三焦能够配合调节机体阴阳气机升降。“肾脑相济”以肾精为物质基础，阳气温煦、推动肾和三焦别通气化、共主枢机可作为功能基础，其生理功能可体现在调节三焦气机和调理脑神。肾阳亏虚、三焦气滞均可引发别通气化不利、“阴升阳降”失常，导致“肾脑相济”乏源，可出现本虚标实、神形兼伤病证如抑郁，且可伴随躯体化症状如疼痛、睡眠障碍、食欲不振等。根据肾与三焦气化相通这一功能特性选择调节少阳枢机以补肾阳、调补少阴枢机以利三焦以维持“肾脑相济”，可同时治疗抑郁和躯体化症状。文章探讨了在阳气作用下肾与三焦气化相通在肾与脑神相关的生理联系如“肾脑相济”、相关病证如抑郁的发病机制和治疗中发挥的作用。