血管内皮是外周组织与血液循环之间的一层选择性的半透膜，不仅能调控血管内外物质交换，还能分泌多种活性物质，以调节血管张力、维持正常血运，对心脏内稳态具有重要调节作用，血管内皮功能障碍可损伤微循环灌注，加重心肌缺血，是冠状动脉微循环障碍（coronary microcirculation dysfunction,CMD）的关键病理机制。“虚气留滞”为CMD的核心病机，“虚气”指心、脾、肾脏气虚损，为发病之本；“留滞”指因虚生气滞、痰瘀，痹阻心络，为发病之标。若血管内皮屏障受损、舒缩失衡可导致血管通透性增加、血管过度收缩，与“虚气”引起的防御固摄、协调脉络功能失调相似；血管内皮凝血-纤溶功能失衡可导致微血栓生成增加，则与“虚气”引起的推动血运功能失常、实邪“留滞”相似，进而影响微血管结构与功能，引发CMD。文章探讨“虚气留滞”理论与CMD血管内皮功能障碍的相关性，以阐述CMD“虚气留滞”病机的科学内涵，并以补虚通滞为治则介绍了中医药靶向调节血管内皮功能干预CMD的相关进展，以期为中西医结合治疗CMD提供理论依据与临床用药参考。