肾癌相关miRNAs及靶基因对肾癌预后的评估价值

聂倩茹, 赵海东, 杨小丽

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华夏医学 ›› 2024, Vol. 37 ›› Issue (02) : 111-119. DOI: 10.19296/j.cnki.1008-2409.2024-02-016

肾癌相关miRNAs及靶基因对肾癌预后的评估价值

  • 聂倩茹, 赵海东, 杨小丽
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摘要

目的 基于美国癌症基因组图谱(TCGA)构建肾癌miRNAs预后风险模型评分公式,分析这个评分公式评估miRNAs及其靶基因作为肾癌预后分子标志物的潜在临床价值。方法 基于TCGA肾癌miRNAs与mRNA测序数据,采用单因素、Lasso和多因素Cox回归分析,构建肾癌miRNAs预后风险模型;通过对靶基因进行GO、KEGG富集分析,筛选相关miRNAs;在临床样本中验证预后风险模型中筛选出的miRNAs及其靶基因的表达。结果 基于TCGA数据库,在肾癌与其癌旁样本转录组数据中共找到94个差异miRNAs和1 226个差异mRNAs,独立预后分析筛选得到7个miRNAs。GO与KEGG富集分析结果提示,7个miRNAs的功能与PI3K-Akt信号通路、钙离子信号通路、MAPK信号通路有关。采集肾癌临床样本,应用qPCR分析,结果显示,5个miRNAs在肾癌临床样本中的表达模式与TCGA数据库中的表达模式一致,miRNAs的8个靶基因表达模式与其在TCGA数据库中的表达趋势一致。免疫组化结果显示,HPGD在肾癌中低表达。结论 构建的肾癌miRNAs预后模型能有效筛选肾癌预后相关miRNAs,这些miRNAs的研究对揭示肾癌发生与发展机制及评估肾癌预后具有重要意义。

关键词

肾癌 / miRNAs / 靶基因 / 预后风险模型

中图分类号

R737.11

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聂倩茹, 赵海东, 杨小丽. 肾癌相关miRNAs及靶基因对肾癌预后的评估价值. 华夏医学. 2024, 37(02): 111-119 https://doi.org/10.19296/j.cnki.1008-2409.2024-02-016

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