目的 通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能，为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法 使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性，然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性，最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图，并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果 乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织，乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短，差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01, Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论 C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调，其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义，需进一步深入研究。