目的 利用Wnt1-Cre和Pax2-Cre小鼠特异性标记颅颌面神经嵴细胞（CNCs）迁移到第一鳃弓时的分化异质性及机制。方法 分别收取胚胎期（E） 8.0～E9.25 Wnt1-Cre;R26R^mTmG及Pax2-Cre;R26R^mTmG小鼠胚胎进行整体荧光观察，利用石蜡切片免疫荧光对E15.5的Pax2-Cre;R26R^Ai9和Wnt1-Cre;R26R^Ai9小鼠所标记的CNCs在颅面部主要组织器官中的谱系分化情况进行比较分析，最后对E10.5的Wnt1-Cre;R26R^mTmG和Pax2-Cre;R26R^mTmG小鼠的第一鳃弓组织中CNCs进行单细胞测序分析，并对差异基因进行荧光定量聚合酶链反应（q-PCR）验证。结果 Pax2-Cre和Wnt1-Cre小鼠特异性标记的CNCs均在E8.0自神经板开始迁移，但Pax2-Cre小鼠仅标记迁移到第一鳃弓的CNCs，而Wnt1-Cre同时标记了迁移到第一和第二鳃弓的CNCs；在分化谱系示踪方面，二者皆标记了CNCs分化形成的颅颌面部组织器官的间充质，但Wnt1-Cre在上腭和舌中标记CNCs更多；在第一鳃弓间充质中，Pax2-Cre所标记的CNCs特异性表达基因主要参与了成骨，而Wnt1-Cre所标记的CNCs特异性表达基因主要参与了肢体发育、细胞迁移和成骨，q-PCR结果也证实了两者高表达差异基因参与了以上功能。结论 本研究结果提示Pax2-Cre小鼠可特异性用于第一鳃弓CNCs及其衍生组织成骨方面的研究。