目的：评估真菌荧光染色法在侵袭性真菌感染（IFIs）石蜡包埋组织病理切片中的应用价值。方法：经真菌培养确诊，同时行组织病理学检查的55例真菌感染患者，其中马尔尼菲篮状菌感染30例，取其石蜡包埋切片分别行过碘酸—希夫（PAS）染色、六胺银（GMS）染色及真菌荧光染色，采用McNemar检验对3种染色方法的检出率进行比较分析。结果：55例样本中，真菌荧光染色检出43例（78.2%）,GMS染色检出37例（67.3%）,PAS染色检出23例（41.8%），真菌荧光染色检出率显著高于GMS染色及PAS染色（P<0.01）;30例马尔尼菲篮状菌感染中，真菌荧光染色检出21例（70.0%）,GMS染色检出14例（46.7%）,PAS染色检出6例（20.0%），真菌荧光染色检出率显著高于GMS染色及PAS染色（P<0.01）。结论:真菌荧光染色在IFIs真菌病理学诊断中检出率高于PAS染色和GMS染色，是组织病理学诊断IFIs的快速、高效的方法。