目的：通过对全国31个省域（不含港澳台地区）的城市公立医院医疗服务投入产出指标（2019—2021年）进行全要素生产率测算，为今后全国城市医疗卫生资源配置和规划提供依据和建议。方法：基于2019—2021年全国31个省域医疗服务投入和产出数据，采用Bootstrap-Malmquist-DEA模型，测算各省域城市公立医院的全要素生产率。结果：2019—2021年全国城市公立医院全要素生产率变化指数（TFPC）为1.083,3年间总体略有增长，呈先降后升趋势，且中部>西部>东部；2019—2020年全国TFPC为0.889，总体略有下降，且西部>中部>东部，2020—2021年全国TFPC为1.216，总体略有增长，且中部>东部>西部。结论：疫情发生后我国城市公立医院医疗服务全要素生产率先降后升，全要素生产率增长水平在各区域间不够均衡，技术进步和技术效率共同影响全要素生产率变化水平，城市公立医院在进行规模扩张的同时应更加注重自身的组织管理能力建设。