目的：探讨广西鸭源H6N2亚型禽流感病毒的分子遗传特征，评估其对哺乳动物BALB/c小鼠的致病性。方法：选择前期在广西分离的2株鸭源性H6N2禽流感病毒A/DK/GX/3101/2018(GX3101)、A/DK/GX/5220/2018(GX5220)，基因测序和遗传进化分析病毒全基因组的核苷酸同源性及遗传进化，受体结合特异性法分析2株病毒的受体结合特性，应用BALB/c小鼠评估鸭源H6N2病毒的致病性。结果：2株H6N2病毒属于欧亚谱系，HA裂解位点处为PQIETG/GL，属低致病性禽流感病毒特征，HA蛋白氨基酸位点出现E190V位点的氨基酸突变，2株病毒均识别与结合禽型SAα-2,3 Gal受体。病毒接种小鼠后，肺组织病毒分离培养阳性，小鼠肺组织出现炎症细胞浸润、肺泡结构完整性破坏，免疫组化检测病毒抗原显示，GX3101病毒接种小鼠的肺组织出现流感病毒核蛋白（NP）阳性。结论：广西鸭源H6N2毒株具有禽流感病毒的特点，可不经适应直接跨种属间屏障感染哺乳动物小鼠，须密切监测家禽中流感病毒H6N2流行和进化演变。