在医学研究中有一个永恒的挑战，就是确定影响因素（X）与疾病（Y）之间的因果联系。即便是目前被普遍接受的医学结论也常常遭到怀疑，比如吸烟与肺癌的关系，肥胖与高血压的关系、糖尿病和心脏病的关系等等。本文尝试提出一个新的理论模式来解释因果联系，并介绍一些推断因果联系的研究设计和分析方法。从哲学的角度，宇宙间万事万物相互关联，形成一个相互依存的网络系统。在研究X-Y关系时，如果X（新冠病毒）与Y（新冠肺炎）之间的关系距离很近，得到的结果大都很明确。若X（吸烟）与Y（肺癌）之间的关系存在较大距离，可能存在大量未知因素与X-Y相连接而形成关系网络系统，在这种情况下X-Y的关系变得复杂且难于确定。而在不同的研究中，相同含义的X或Y变量，可以用不同的方法来测量。比如，吸烟这个变量可以用体内尼古丁的代谢产物来测量，也可以使用调查数据，例如是否吸烟、吸烟的年数和每天吸烟支数来测量。用不同的方法测量相同的变量进一步增加了研究结果的不确定性。因此，对因果推断的研究结果产生质疑很正常，而且是必须的，这样才能促进更深入的研究。