目的：探讨宏基因组二代测序（m NGS）在肺部感染患者病原体检测中的应用价值。方法：回顾性分析2020年11月1日至2021年8月31日广西医科大学第一附属医院老年呼吸内科收治的肺部感染患者58例，均行传统病原学检测、血清学检测及支气管肺泡灌洗液mNGS。统计患者的病原体分布情况，比较3种检测方法在肺部感染和合并肺部基础疾病中的病原体检出率。结果：58例肺部感染患者中，共检出34种微生物，最常见的是分枝杆菌，其次为曲霉菌。mNGS检出肺部感染阳性率为72.41%，高于传统方法（24.14%）和血清学检测（25.86%）（均P<0.05）;mNGS细菌检出率高于传统方法和血清学检测，真菌检出率低于传统方法和血清学检测，非典型病原体检出率低于血清学检测（均P<0.05）,3种检测方法的病毒检出率比较，差异无统计学意义（P>0.05）。在合并支气管扩张的患者中，mNGS病原体检出率高于血清学检测（P<0.05）。结论：m NGS相比传统方法和血清学检测，其细菌检出率及对合并支气管扩张的肺部感染患者病原体检出率更高。