基于胞嘧啶碱基编辑器构建ESM1基因敲除Hela细胞系

汪悦, 郭颖, 庞娅璇, 崔堉熙, 麻丽霞

长治医学院学报 ›› 2024, Vol. 38 ›› Issue (05) : 323-328.

基于胞嘧啶碱基编辑器构建ESM1基因敲除Hela细胞系

  • 汪悦, 郭颖, 庞娅璇, 崔堉熙, 麻丽霞
作者信息 +
History +

摘要

目的:基于胞嘧啶碱基编辑器(CBE)提前引入终止密码子构建内皮细胞特异性分子1 (ESM1)基因敲除Hela细胞系。方法:根据NCBI数据库ESM1序列信息(Gene ID:11082),利用在线软件Benchling在ESM1基因1号外显子上设计2个向导sgRNA,构建对应的pX330-ESM1-sgRNA表达载体。将BE4max、ACBE-ASR、pX330-ESM1-sgRNA 3个质粒共转染Hela细胞,用嘌呤霉素富集筛选CBE工作阳性细胞。PCR扩增含靶点的序列并进行Sanger测序,比较2个sgRNA的效率。通过有限稀释法筛选单克隆细胞,扩大培养后进行测序及Western Blot检测。结果:测序结果显示pX330-ESM1-sgRNA表达质粒构建成功,sgRNA2的编辑效率为66%,远高于sgRNA1的编辑效率;10组细胞单克隆中有6组细胞的靶点进行了双等位基因精确编辑,成功提前引入了终止密码子;Western Blot结果显示ESM1被成功提前终止翻译,达到基因敲除的目的。结论:基于胞嘧啶碱基编辑器提前引入终止密码子的策略成功构建了ESM1基因敲除Hela细胞系,为后续研究ESM1在宫颈癌中的作用机制提供了实验材料,奠定了基础。

关键词

胞嘧啶碱基编辑器 / ESM1 / 基因敲除

中图分类号

Q78 / R737.33

引用本文

导出引用
汪悦, 郭颖, 庞娅璇, 崔堉熙, 麻丽霞. 基于胞嘧啶碱基编辑器构建ESM1基因敲除Hela细胞系. 长治医学院学报. 2024, 38(05): 323-328

基金

山西省基础研究计划(自由探索类)(202303021212231); 长治医学院博士科研启动基金(202213); 山西省高等学校科技创新计划项目(2023L210); 大学生创新创业训练计划项目(20230862)

评论

Accesses

Citation

Detail

段落导航
相关文章

/